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报告一

题  目：从基础科学到应用科学：突变理论与突变机制驱动的基因工程工具开发

主讲人：张勇 研究员

时  间：2024年10月15日（星期二）下午14:00

地  点：生科楼一楼报告厅（动物科学Seminar）

联系人：赵要风 教授      

联系方式：62731142-2003   

主讲人简介

张勇，中科院动物所研究员，1997-2006年在北京大学获得学士和博士学位，2007-2011年在芝加哥大学从事博士后研究， 2011年加入动物所。张研究员聚焦重复型新基因研究，在基因起源的突变机制、突变机制对基因功能演化的影响、突变机制相关的转化应用等方面有较深积累。张研究员在Cell、Nature Ecology & Evolution、Nature Biotechnology等杂志发表论文80篇，引用超过8500次。

主要论著：

l  Zhang, T., Tan, S., Tang, N., Li, Y., Zhang, C., Sun, J., Guo, Y., Gao, H., Cai, Y., Sun, W., Wang, C., Fu, L., Ma, H., Wu, Y., Hu, X., Zhang, X., Gee, P., Yan, W., Zhao, Y., Chen, Q., … Zhang, Y. E. (2024). Heterologous survey of 130 DNA transposons in human cells highlights their functional divergence and expands the genome engineering toolbox. Cell, 187(14), 3741–3760.e30.

l  Jia, H., Tan, S., Cai, Y., Guo, Y., Shen, J., Zhang, Y., Ma, H., Zhang, Q., Chen, J., Qiao, G., Ruan, J., & Zhang, Y. E. (2024). Low-input PacBio sequencing generates high-quality individual fly genomes and characterizes mutational processes. Nature communications, 15(1), 5644.

l  Xiang, G., Li, Y., Sun, J., Huo, Y., Cao, S., Cao, Y., Guo, Y., Yang, L., Cai, Y., Zhang, Y. E., & Wang, H. (2024). Evolutionary mining and functional characterization of TnpB nucleases identify efficient miniature genome editors. Nature biotechnology, 42(5), 745–757.

l  Zhang, D., Leng, L., Chen, C., Huang, J., Zhang, Y., Yuan, H., Ma, C., Chen, H., & Zhang, Y. E. (2022). Dosage sensitivity and exon shuffling shape the landscape of polymorphic duplicates in Drosophila and humans. Nature ecology & evolution, 6(3), 273–287.

报告二

题  目：新型高通量单细胞技术及贝叶斯网络推断细胞状态转化关键因子

主讲人：蓝勋 副教授

时  间：2024年10月15日（星期二）下午16:00

地  点：生科楼一楼报告厅（动物科学Seminar）

联系人：赵要风 教授      

联系方式：62731142-2003   

主讲人简介

蓝勋，清华大学基础医学院研究员，副教授，博士生导师。实验室开发新型高通量组学技术和分析方法，主要研究肿瘤免疫微环境中不同类型细胞之间相互作用及免疫抑制的机制。发表论文70余篇，谷歌引用4300余次，h-index 34，篇均影响因子大于10, 在包括Science、Nature Biotechnology, Nature Cell Biology, Nature Metabolism等杂志发表通讯或者共通讯作者论文20余篇，入选“中国百篇最具影响国际学术论文” 。担任Science Bulletin杂志青年编辑和包括Science，Nature Communications, Nucleic Acids Research等在内的三十余部期刊审稿人。北京抗癌协会青年理事会理事，医工转化与健康产业融合学会委员，重大疾病组学信息学委员。

主要论著：

l  Zhu, M., Xu, R., Yuan, J., Wang, J., Ren, X., Cong, T., You, Y., Ju, A., Xu, L., Wang, H., Zheng, P., Tao, H., Lin, C., Yu, H., Du, J., Lin, X., Xie, W., Li, Y., & Lan, X. (2024). Tracking-seq reveals the heterogeneity of off-target effects in CRISPR-Cas9-mediated genome editing. Nature biotechnology, 10.1038/s41587-024-02307-y.

l  Sun, K., Liu, X., & Lan, X. (2024). A single-cell atlas of chromatin accessibility in mouse organogenesis. Nature cell biology, 26(7), 1200–1211.

l  Sun, K., Liu, X., Xu, R., Liu, C., Meng, A., & Lan, X. (2024). Mapping the chromatin accessibility landscape of zebrafish embryogenesis at single-cell resolution by SPATAC-seq. Nature cell biology, 26(7), 1187–1199.

l  Li, J., Chen, J., Sun, X., Yang, H., Sun, K., Liu, C., Wang, Y., Xu, M., Ji, X., Zhang, J., Wu, X., Wang, A., Fan, B., Zhang, X., Wu, Y., Cui, P., Peng, J., Zhao, Y., Wu, W., Yu, H., … Lan, X. (2024). Uncovering chromatin accessibility and cancer diagnostic potential via cell-free DNA utilization. Science bulletin, S2095-9273(24)00247-0.

Hao, J., Liu, C., Gu, Z., Yang, X., Lan, X., & Guo, X. (2024). Dysregulation of Wnt/β-catenin signaling contributes to intestinal inflammation through regulation of group 3 innate lymphoid cells. Nature communications, 15(1), 2820. 

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